22 июля 2008 года принят Федеральный закон №148 «О внесении изменений в Градостроительный Кодекс Российской Федерации», который утвердил переход от системы государственного лицензирования строительной деятельности к системе саморегулирования.

19 декабря 2008 года подписан приказ Государственной корпорации по атомной энергии «Росатом» №673 «О первоочередных мерах по реализации положений Федерального закона от 22 июля 2008 г. «О внесении изменений в Градостроительный Кодекс Российской Федерации». Приказ был подготовлен в целях перехода организаций Госкорпорации на принципы саморегулирования строительной деятельности. Рабочую группу по обеспечению создания и развития саморегулируемых организаций атомной отрасли возглавил советник генерального директора Госкорпорации «Росатом» Виктор Семенович Опекунов.

Точкой отсчета истории создания СРО атомной отрасли (СРО НП «СОЮЗАТОМСТРОЙ», СРО НП «СОЮЗАТОМПРОЕКТ», СРО НП «СОЮЗАТОМГЕО») является 12 февраля 2009 года, когда в Госкорпорации «Росатом» состоялось первое учредительное собрание трех организаций.

Учредителями СРО НП «СОЮЗАТОМСТРОЙ» стали 24 предприятия:
ОАО «Атомэнергопроект», ОАО «СПбАЭП», ОАО «НИАЭП», ОАО «АТОМТЕХЭНЕРГО», ОАО «АТОМЭНЕРГОРЕМОНТ», ОАО «Е-4 Центрэнергомонтаж», ОАО «Энергоспецмонтаж», ОАО «ИСК Атомстрой», ЗАО «Концерн Титан-2», ЗАО «РусАтомСтрой-Инвест», ОАО «ОЭК», ЗАО «Атомстройэкспорт», ФГУП «ГХК», ОАО «Стальконструкция-Фаст», ФГУП «НИКИЭТ им. Долежаля», ЗАО «Оргэнергострой», ФГУП «СНПО «Элерон», ЗАО «ТВЭЛ-СТРОЙ», ЗАО «СМК Юг», ОАО «Трест САЭМ», ОАО «НПК «Дедал», ОАО «ОКБ «ГИДРОПРЕСС», ОАО «Концерн «Энергоатом», ОАО «Группа Е-4»

Учредителями СРО НП «СОЮЗАТОМПРОЕКТ» стали 23 предприятия:
ОАО «Атомэнергопроект», ОАО «СПбАЭП», ОАО «НИАЭП», ОАО «Стальконструкция-Фаст», ЗАО «Оргэнергострой», ФГУП «ГСПИ», ОАО «Гиредмет», ФГУП «НИКИЭТ им. Доллежаля», ОАО «Головной институт ВНИПИЭТ», ОАО «УПИИ «ВНИПИЭТ», ЗАО «Концерн Титан-2», ФГУП «ГХК», ОАО «ИСК Атомстрой», ОАО «Атомтехэнерго», ОАО «Атомэнергоремонт», ФГУП «СНПО «Элерон», ОАО «КПИИ ВНИПИЭТ», ОАО «НПК «Дедал», ФГУП «НИИ НПО «ЛУЧ», ОАО «ВНИПИпромтехнологии», ОАО «Концерн Энергоатом», ООО «ВНИИАЭС-Проектный Офис», ОАО «СПИИ ВНИПИЭТ»

Учредителями СРО НП «СОЮЗАТОМГЕО» стали 13 предприятий:
ОАО «Атомэнергопроект», ОАО «СПбАЭП», ОАО «НИАЭП», ФГУП «ГСПИ», ОАО «СПбНИИИЭИЗ», ОАО «ИСК Атомстрой», ОАО «УПИИ «ВНИПИЭТ», ОАО «КПИИ ВНИПИЭТ», ФГУП «ГХК», ОАО «ВНИПИпромтехнологии», ОАО «Концерн Энергоатом», ООО «ВНИИАЭС-Проектный Офис», ОАО «СПИИ ВНИПИЭТ»

24 марта 2009 года некоммерческие партнерства «СОЮЗАТОМСТРОЙ», «СОЮЗАТОМПРОЕКТ», «СОЮЗАТОМГЕО» прошли процедуру юридической регистрации в Министерстве юстиции Российской Федерации.

28 апреля 2009 года состоялось первое после учредительного собрания Общее собрание членов некоммерческих партнерств. В рамках мероприятия Виктор Семенович Опекунов был избран президентом трех организаций. На собрании были приняты документы, обязательные для получения статуса СРО: требования к выдаче свидетельств о допуске к работам, стандарты «Общие требования к выполнению работ» и «Порядок разработки, утверждения, внесения изменений и отмены стандартов», правила саморегулирования «Требования к страхованию гражданской ответственности».

30 июня 2009 года Ростехнадзор РФ присвоил некоммерческим партнерствам статус саморегулируемых организаций с внесением соответствующих записей в государственный реестр саморегулируемых организаций под номерами:
· СРО НП «СОЮЗАТОМСТРОЙ» – 016,
· СРО НП «СОЮЗАТОМПРОЕКТ» – 010,
· СРО НП «СОЮЗАТОМГЕО» – 002.

1 января 2010 года в соответствии со статьей 18 Федерального закона №148 «О внесении изменений в Градостроительный Кодекс Российской Федерации» прекратили действие строительные лицензии, которые выдавались Федеральным лицензионным центром» (ФЛЦ) при Министерстве регионального развития. Таким образом, на всей территории России вступила в силу новая система регулирования строительной отрасли – саморегулирование.

3 февраля 2010 года вступило в силу постановление Правительства Российской федерации №48 «О минимально необходимых требованиях к выдаче саморегулируемыми организациями свидетельств о допуске к работам на особо опасных и технически сложных объектах капитального строительства, оказывающим влияние на безопасность указанных объектов».

23 июня 2010 года вступил в силу приказ Министерства регионального развития Российской Федерации «Об утверждении Перечня видов работ по инженерным изысканиям, по подготовке проектной документации, по строительству, реконструкции, капитальному ремонту объектов капитального строительства, которые оказывают влияние на безопасность объектов капитального строительства». В связи с выходом данного документа, СРО атомной отрасли вынуждены были осуществить замену свидетельств о допуске к работам, выданным в соответствии с приказом Минрегиона РФ №274 всем организациям-членам СРО.

24 марта 2011 года Правительство Российской Федерации приняло постановление № 207 «О минимально необходимых требованиях к выдаче саморегулируемыми организациями свидетельств о допуске к работам на особо опасных и технически сложных объектах капитального строительства, оказывающим влияние на безопасность указанных объектов». С момента официального опубликования указанного документа, постановление Правительства Российской Федерации от 3 февраля 2010 г. № 48 утратило силу. Особенность постановления №207 заключается в том, что требования к выдаче свидетельств о допуске к работам были дифференцированы в зависимости от особой опасности либо
технической сложности объекта капитального строительства. Самый высокий уровень требований был установлен для объектов использования атомной энергии.

В период с 2011 по 2016 гг. СРО атомной отрасли заключили соглашения о взаимодействии и сотрудничестве с Госкорпорацией «Росатом», ОАО «Концерн Росэнергоатом», ОАО «Производственная система Росатома», ОАО «Атомэнергопроект», ОАО «Нижегородский Атомэнергопроект», ОАО «Горно-химический комбинат», частное учреждение ГК «Росатом» «Отраслевой центр капитального строительства». ОАО «ВНИИНМ им. Академика А.А. Бочвара», ОАО «НИКИМТ-Атомстрой».